山东省从2013年起，在本科一批、二批和专科批次都采用了平行志愿的投档方式。平行志愿投档规则为分数优先、遵循志愿、多次检索、一次投档，即考试院在投递学生档案时，先依据考生高考成绩从高分到低分排队，然后按照考生的排名先后，从高分到低分依次投档。
在轮到考生投档时，会依据考生自己所报的6个志愿的先后顺序，从前到后依次检索，直到考生档案能够投档出去为止，每名考生只有唯一的一次投档资格。也就是说在平行志愿投档过程中，若考生报高了，前面的志愿没有投档出去，会接着检索他的下一个志愿。而一旦投档到某一所高校，则他即便因为专业分数线不够且不服从调剂的原因被退档的话，也不会往剩余的其他高校再投档了。所以在平行志愿报考中，最大的风险是提档后被退档。考生在报考平行志愿时，一定要把6个专业选满并选择服从专业调剂，以免出现退档的遗憾。
在每个批次投档录取结束之前，高校还会面向达到批次线却未被录取考生进行征集志愿，相关信息会发布在山东省教育考试院的官方网站上。考生和家长在报考后等待录取阶段，也要留意查询录取结果，以免错过征集志愿的机会。此外，山东省今年部分高校新增综合评价录取方式，需要考生按照相应的规定报名，获得资格的考生在报考时要在本科提前批次填报。