少年班的创办，是我国教育史上的一项重大创举，对我国教育事业的发展产生了深远的影响。但是，在少年班三十年历程中，质疑声从未间断。
有人认为，少年班是“拔苗助长”，是“毁灭天才”；也有人认为，让十几岁的孩子过早进入大学是“不人道”的；还有人认为少年班是给少数人的“特权”，违背了教育公平等等。
带着这些质疑，科大少年班整整走过了30年，这在国内高校少年班中独一无二。为什么要办少年班？30年实践之后，科大人有着充分的理由。
智力超常少年群体客观存在需要少年班等特殊教育模式。专家以我国人口规模估算，我国智力超常少年约有3万。这些超常少年在天赋、天资、素质上异于常人，常规教育很难满足其需求，需要更高层次的开导和指引，少年班就是这样一种特殊的高端人才培养形式。
一位少年班毕业生对记者说：“媒体总问我为什么要上少年班？我总是反问媒体：‘我不来少年班，我去哪里？’当我的同龄人还在学习初一课本时，我已经学完了高中知识，难道我要用6年时间，把我已经学会的东西再学一遍吗？”科大少年班负责人说，科大少年班30年毕业1027人，其中935人获得了博士、硕士学位，实践证明了少年班不是中国高等教育的主流，但是一个绝对不能缺少的组成部分。
人才学研究表明，科学创造的最佳年龄区是25至45岁。1978年以来，科大少年班的办学实践表明，遵循科学发现最佳年龄区规律，开展超常教育，是完全可行的。
“少年大学生一般十三或十四五岁上大学，大学4年左右，硕士3年，博士3年，这样，他们在二十四五岁就可以获得博士学位，比一般人提前五年，也就是说，他们可以比一般学生提前五年进入科学创造的最佳年龄区。这是非同寻常的5年，这些少年大学生如果继续努力，就可能在科学事业上为人类做出大的贡献。”科大少年班管委员主任陈卿说。
对于把我国建设成为创新型国家而言，智力超常少年是极其宝贵的潜在人才资源。探索适应智力超常少年的超常教育模式，是我国经济社会发展的战略需求。二战后，世界各国都十分重视智力超常青少年的教育。如美国国会在1973年通过《天才教育法》，决定进一步为天才教育提供物力、人力和法律保证。