第二炮兵工程学院是全国、全军重点高等院校之一，是全军重点建设的院校。学院在1986年被批准为硕士学位授予单位，在1993年被批准为博士学位授予单位。现在工学、军事学、法 学3个学科门类具有14个硕士点和2个博士点，并在"控制科学与工程"学科设立了博士后科研流动站。1996年，"导航、制导与控制"、"兵器发射理论与技术"2个具有博士学位授予权的学科被确定为全军重点学科，"火炮、自动武器与弹药工程"学科的实验室被确定为全军重点实验室.
学院拥有一支思想素质好、学术造诣较深、教学科研能力强、年龄结构相对合理的研究生导师队伍。1985年以来，先后有90多人具有高级专业技术职务的专家、教授担负起培养 研究生 的任务，现有研究生导师67人，其中博士生导师9人。