山东中医药大学的中医和中药类专业，历来是学校特色。2016年，该校在山东省内招生的本科计划数是3799人，而在去年，这一计划数是3220人，数量增加了579人。
从专业录取批次来说，2016年在山东省内本科一批招生的专业有中医学、中西医临床医学、针灸推拿学、中药学、中草药栽培与鉴定、中药资源与开发6个专业，其中中药资源与开发是新增在一本招生的专业。除了这六个专业外，其余专业在省内计划仍在本科二批录取。
值得一提的是，学校新增中药资源与开发、药物制剂和眼视光医学3个本科专业，每专业计划招生60人；学校首次在中医学专业中增设儿科方向招生计划，其中中医学（“5+3”一体化，研究生阶段：儿科方向）计划30人，中医学（五年制，儿科方向）计划90人。新增专业和方向全部面向省内招。