日前，江苏省教育厅公布了“十三五”江苏省重点学科立项学科名单，来自南京大学、东南大学等56所高校和江苏省委党校的313个学科入选。以下是南通大学入选“十三五”江苏省重点学科立项学科名单：
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 学科代码 | 学科名称 | 建设类别 |
| 1 | 10304 | 南通大学 | 1002 | 临床医学 | 一级学科省重点学科 |
| 2 | 10304 | 南通大学 | 810 | 信息与通信工程 | 一级学科省重点学科 |
| 3 | 10304 | 南通大学 | 501 | 中国语言文学 | 一级学科省重点（培育）学科 |
| 4 | 10304 | 南通大学 | 401 | 教育学 | 一级学科省重点（培育）学科 |
| 5 | 10304 | 南通大学 | 1304 | 美术学 | 一级学科省重点（培育）学科 |
| 6 | 10304 | 南通大学 | 1009 | 特种医学 | 一级学科省重点（培育）学科 |
| 7 | 10304 | 南通大学 | 821 | 纺织科学与工程 | 一级学科省重点（培育）学科 |