日前，江苏省教育厅公布了“十三五”江苏省重点学科立项学科名单，来自南京大学、东南大学等56所高校和江苏省委党校的313个学科入选。以下是南京农业大学入选“十三五”江苏省重点学科立项学科名单：
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 学科代码 | 学科名称 | 建设类别 |
| 1 | 10307 | 南京农业大学 | 712 | 科学技术史 | 一级学科省重点学科 |
| 2 | 10307 | 南京农业大学 | 713 | 生态学 | 一级学科省重点学科 |
| 3 | 10307 | 南京农业大学 | 1204 | 公共管理 | 一级学科省重点学科 |
| 4 | 10307 | 南京农业大学 | 905 | 畜牧学 | 一级学科省重点学科 |
| 5 | 10307 | 南京农业大学 | 909 | 草学 | 一级学科省重点学科 |
| 6 | 10307 | 南京农业大学 | 703 | 化学 | 一级学科省重点（培育）学科 |
| 7 | 10307 | 南京农业大学 | 802 | 机械工程 | 一级学科省重点（培育）学科 |