日前，江苏省教育厅公布了“十三五”江苏省重点学科立项学科名单，来自南京大学、东南大学等56所高校和江苏省委党校的313个学科入选。以下是南京审计大学入选“十三五”江苏省重点学科立项学科名单：
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 学科代码 | 学科名称 | 建设类别 |
| 1 | 11287 | 南京审计大学 | 201 | 理论经济学 | 一级学科省重点（培育）学科 |
| 2 | 11287 | 南京审计大学 | 714 | 统计学 | 一级学科省重点建设学科 |
| 3 | 11287 | 南京审计大学 | 701 | 数学 | 一级学科省重点建设学科 |
| 4 | 11287 | 南京审计大学 | 305 | 马克思主义理论 | 一级学科省重点建设学科 |
| 5 | 11287 | 南京审计大学 | 1204 | 公共管理 | 一级学科省重点建设学科 |
| 6 | 11287 | 南京审计大学 | 812 | 计算机科学与技术 | 一级学科省重点建设学科 |