国家重点学科是国家根据发展战略与重大需求，则有确定并重点建设的培养创新人才、开展科学研究的重要基地，在高等教育学科体系中居于骨干和引领地位，满足经济建设和社会发展对高层次创新人才的需求，为建设创新型国家提供高层次人才和智力支撑，充分体现全国各高校科学研究和人才培养的实力和水平。到2007年为止，共组织了三次评选工作，共评选出全国286个一级学科国家重点学科、677个二级学科国家重点学科、217个国家重点（培育）学科，其中一级学科国家重点学科所覆盖的二级学科均为国家重点学科。
清华大学
22个国家重点一级学科
材料科学与工程、电气工程、电子科学与技术、动力工程及工程热物理、光学工程、核科学与技术、化学工程与技术、机械工程、计算机科学与技术、建筑学、控制科学与工程、力学、生物医学工程、水利工程、土木工程、信息与通信工程、工商管理、管理科学与工程、生物学、数学、物理学、药学 。
北京大学
18个国家重点一级学科
法学、社会学、政治学、电子科学与技术、计算机科学与技术、力学、理论经济学、大气科学、地理学、化学、生物学、数学、物理学、历史学、中国语言文学、口腔医学、药学、哲学 。
浙江大学
14个国家重点一级学科
材料科学与工程、电气工程、动力工程及工程热物理、光学工程、机械工程、控制科学与工程、生物医学工程、土木工程、管理科学与工程、化学、数学、农业资源利用、园艺学、植物保护 。
复旦大学
11个国家重点一级学科
电子科学与技术、理论经济学、化学、生物学、数学、物理学、资讯传播学、中国语言文学、基础医学、中西医结合、哲学。
上海交通大学
9个国家重点一级学科
材料科学与工程、船舶与海洋工程、动力工程及工程热物理、机械工程、计算机科学与技术、控制科学与工程、力学、生物医学工程、管理科学与工程 。
哈尔滨工业大学
9个国家重点一级学科
材料科学与工程、动力工程及工程热物理、机械工程、计算机科学与技术、控制科学与工程、力学、土木工程、仪器科学与技术、管理科学与工程
中国人民大学
8个国家重点一级学科
法学、马克思主义理论、社会学、理论经济学、应用经济学、工商管理、资讯学、哲学 。
北京航空航天大学
8个国家重点一级学科
材料科学与工程、航空宇航科学与技术、机械工程、计算机科学与技术、控制科学与工程、力学、仪器科学与技术、管理科学与工程。
南京大学
8个国家重点一级学科
计算机科学与技术、地质学、化学、生物学、数学、天文学、物理学、中国语言文学 。
西安交通大学
8个国家重点一级学科
材料科学与工程、电气工程、动力工程及工程热物理、机械工程、控制科学与工程、生物医学工程、工商管理、管理科学与工程 。