空军第二飞行学院是一所初级飞行指挥学院，前身是1949年11月组建的空军第二轰炸学校，当年12月改名为中国人民解放军第二航空学校，1966年3月至1969年4月先后由吉林长春迁址四川夹江，1976年改名为空军第二航空学校，1986年更名为空军第二飞行学院。学院开设：
1.轰炸航空兵初级指挥专业：(本科)，学制4年(与长春飞行学院合计)，培养具有轰炸、运输机飞行驾驶技术，初步具备航空兵部队指挥、管理能力的初级指挥干部。
招生对象：长春飞行学院学员。
毕业学员适于在轰炸航空兵、运输航空兵部队担任飞行工作。
2.轰炸、运输空中领航专业：(本科)，学制4年(与长春飞行学院合计)，培养具有空中领航、轰炸技能，初步具备航空兵部队指挥、管理能力的初级指挥干部。
招生对象：长春飞行学院学员。
毕业学员适于在轰炸、运输航空兵部队担任飞行领航指挥干部。
3.地面领航专业：(本科学制2年；大专学制3年)，培养具有地面领航理论和指挥引导技能，初步具备指挥、管理部队能力的初级指挥干部。
招生对象：大专为地方应届高中毕业生和具有高中毕业文化程度的优秀士兵；本科为飞行学院不适合飞行的学员。
毕业学员适于在歼击、强击航空兵和空军各级指挥所任地面领航指挥干部。
4.飞行管制专业：(大专学制1年；本科学制2年)，培养空军管制部门具有飞行管理理论和技能，初步具备指挥、管理部队能力的初级指挥干部。
招生对象：飞行学院不适合飞行的学员。
毕业学员适于在空军各级航空管制部门担任飞行管制指挥干部。
5.空中通信专业：(本科)，学制4年(与长春飞行学院合计)，培养飞行院校空中通信教学工作的专业技术干部。
招生对象：长春飞行学院学员。
毕业学员适于在空军飞行院校从事空中通信教学工作。
6.空中领航专业：(本科)，学制2年，培养从事空军各领航部门、飞行院校领航理论教学工作的专业技术干部。
招生对象：飞行学院不适合飞行的学员和具有大专学历的教员。
毕业学员适于在空军各级领航部门、飞行院校从事领航理论教学工作。
7.空中通信射击专业：(大专)，学制2年，培养具有空中通信射击技能，初步具备指挥、管理部队能力的初级指挥干部。
招生对象：空中通信射击士官。
毕业学员适于在轰炸、运输航空兵部队担任空中通信射击指挥干部。